Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4eQ9R0Q8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4eQ9R0Q8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms