Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMOD3Q9NYL9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMOD3Q9NYL9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms