Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SMC4Q9NTJ3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMC4Q9NTJ3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMC4Q9NTJ3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC4Q9NTJ3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC4Q9NTJ3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC4Q9NTJ3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC4Q9NTJ3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC4Q9NTJ3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC4Q9NTJ3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC4Q9NTJ3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC4Q9NTJ3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC4Q9NTJ3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC4Q9NTJ3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC4Q9NTJ3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC4Q9NTJ3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms