Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STN1Q9H668 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STN1Q9H668 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
STN1Q9H668 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
STN1Q9H668 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STN1Q9H668 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STN1Q9H668 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STN1Q9H668 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
STN1Q9H668 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
STN1Q9H668 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
STN1Q9H668 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
STN1Q9H668 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
STN1Q9H668 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
STN1Q9H668 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
STN1Q9H668 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STN1Q9H668 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STN1Q9H668 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STN1Q9H668 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STN1Q9H668 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STN1Q9H668 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STN1Q9H668 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STN1Q9H668 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STN1Q9H668 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
STN1Q9H668 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STN1Q9H668 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms