Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2X0

Ankrd39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd39Q9D2X0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ankrd39Q9D2X0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ankrd39Q9D2X0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ankrd39Q9D2X0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ankrd39Q9D2X0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ankrd39Q9D2X0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ankrd39Q9D2X0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ankrd39Q9D2X0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ankrd39Q9D2X0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ankrd39Q9D2X0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ankrd39Q9D2X0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ankrd39Q9D2X0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ankrd39Q9D2X0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms