Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1G1

Rab1b, Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1bQ9D1G1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab1bQ9D1G1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms