Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nde1Q9CZA6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nde1Q9CZA6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms