Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms