Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC9Q96Q05 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC9Q96Q05 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms