Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMARCD1Q96GM5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD1Q96GM5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms