Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRAMD1AQ96CP6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRAMD1AQ96CP6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRAMD1AQ96CP6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRAMD1AQ96CP6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRAMD1AQ96CP6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRAMD1AQ96CP6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRAMD1AQ96CP6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms