Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTE0

Sdhaf4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdhaf4Q8BTE0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdhaf4Q8BTE0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdhaf4Q8BTE0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdhaf4Q8BTE0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdhaf4Q8BTE0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdhaf4Q8BTE0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdhaf4Q8BTE0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdhaf4Q8BTE0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdhaf4Q8BTE0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdhaf4Q8BTE0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdhaf4Q8BTE0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdhaf4Q8BTE0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdhaf4Q8BTE0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdhaf4Q8BTE0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdhaf4Q8BTE0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms