Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pdzrn3Q69ZS0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzrn3Q69ZS0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms