Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Epha6Q62413 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Epha6Q62413 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Epha6Q62413 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha6Q62413 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms