Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms