Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC27A3Q5K4L6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC27A3Q5K4L6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC27A3Q5K4L6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC27A3Q5K4L6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms