Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hs3st6Q5GFD5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hs3st6Q5GFD5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms