Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTCH1Q13635 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PTCH1Q13635 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTCH1Q13635 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
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