Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IFT88Q13099 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
IFT88Q13099 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IFT88Q13099 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IFT88Q13099 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
IFT88Q13099 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IFT88Q13099 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IFT88Q13099 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT88Q13099 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT88Q13099 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT88Q13099 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IFT88Q13099 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT88Q13099 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IFT88Q13099 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IFT88Q13099 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT88Q13099 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IFT88Q13099 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT88Q13099 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT88Q13099 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT88Q13099 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IFT88Q13099 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IFT88Q13099 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT88Q13099 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IFT88Q13099 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT88Q13099 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IFT88Q13099 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFT88Q13099 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IFT88Q13099 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFT88Q13099 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT88Q13099 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IFT88Q13099 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IFT88Q13099 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT88Q13099 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT88Q13099 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFT88Q13099 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT88Q13099 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT88Q13099 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT88Q13099 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT88Q13099 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IFT88Q13099 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT88Q13099 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT88Q13099 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT88Q13099 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT88Q13099 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT88Q13099 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT88Q13099 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT88Q13099 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT88Q13099 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT88Q13099 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT88Q13099 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT88Q13099 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT88Q13099 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT88Q13099 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT88Q13099 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT88Q13099 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT88Q13099 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IFT88Q13099 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFT88Q13099 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT88Q13099 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT88Q13099 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT88Q13099 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IFT88Q13099 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT88Q13099 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT88Q13099 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFT88Q13099 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFT88Q13099 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT88Q13099 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFT88Q13099 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT88Q13099 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT88Q13099 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT88Q13099 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFT88Q13099 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT88Q13099 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFT88Q13099 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT88Q13099 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFT88Q13099 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IFT88Q13099 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFT88Q13099 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFT88Q13099 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFT88Q13099 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFT88Q13099 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFT88Q13099 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFT88Q13099 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IFT88Q13099 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFT88Q13099 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IFT88Q13099 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFT88Q13099 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFT88Q13099 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFT88Q13099 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFT88Q13099 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFT88Q13099 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFT88Q13099 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFT88Q13099 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFT88Q13099 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFT88Q13099 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFT88Q13099 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFT88Q13099 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFT88Q13099 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFT88Q13099 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFT88Q13099 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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