Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
PRDM2Q13029 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
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