Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 NUP159YIL115C 4383 nt3.36□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 STE6YKL209C 3873 nt3.36□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 STU2YLR045C 2667 nt3.36□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 DSF2YBR007C 2211 nt3.35□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 FAS1YKL182W 6156 nt3.35□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 ARF1YDL192W 546 nt3.35□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 PSF1YDR013W 627 nt3.35□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 APA2YDR530C 978 nt3.35□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 RGI1YER067W 486 nt3.35□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 RPS23AYGR118W 438 nt3.35□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 YKL091CYKL091C 933 nt3.35□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 YKL123WYKL123W 381 nt3.35□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 SDO1YLR022C 753 nt3.35□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 YOR152CYOR152C 771 nt3.35□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 CUP9YPL177C 921 nt3.35□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 YPR053CYPR053C 456 nt3.35□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 RPS23BYPR132W 438 nt3.35□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 CIN1YOR349W 3045 nt3.35□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 YKL131WYKL131W 522 nt3.34□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 YLR012CYLR012C 300 nt3.34□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 YSF3YNL138W-A 258 nt3.34□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 VAM10YOR068C 345 nt3.34□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 CAT5YOR125C 702 nt3.34□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 SPR2YOR214C 711 nt3.34□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 YOR238WYOR238W 912 nt3.34□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 YPR153WYPR153W 423 nt3.34□□□□□ -1.87
CTF3Q12748 SEC27YGL137W 2670 nt3.34□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 VBA4YDR119W 2307 nt3.33□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 PKH1YDR490C 2301 nt3.33□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 MET10YFR030W 3108 nt3.33□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 PEX10YDR265W 1014 nt3.33□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 YEL075CYEL075C 369 nt3.33□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 YHL026CYHL026C 948 nt3.33□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 MRP8YKL142W 660 nt3.33□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 NDL1YLR254C 570 nt3.33□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 YMR087WYMR087W 855 nt3.33□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 PEX15YOL044W 1152 nt3.33□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 GRX7YBR014C 612 nt3.33□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 NTO1YPR031W 2247 nt3.33□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 SLY41YOR307C 1362 nt3.33□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 RPL13AYDL082W 600 nt3.32□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 PET100YDR079W 336 nt3.32□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt3.32□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 RGI2YIL057C 495 nt3.32□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 CCE1YKL011C 1062 nt3.32□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 YPT6YLR262C 648 nt3.32□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 TUM1YOR251C 915 nt3.32□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 SPA2YLL021W 4401 nt3.32□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 ATG21YPL100W 1491 nt3.32□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 ERT1YBR239C 1590 nt3.32□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 ENP2YGR145W 2124 nt3.32□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 FLO5YHR211W 3228 nt3.31□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 SEC15YGL233W 2733 nt3.31□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 TGL3YMR313C 1929 nt3.31□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 CDC40YDR364C 1368 nt3.31□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 GUK1YDR454C 564 nt3.31□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 MIG3YER028C 1185 nt3.31□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 LST7YGR057C 729 nt3.31□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 RPS30AYLR287C-A 192 nt3.31□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 BET5YML077W 480 nt3.31□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 HHF2YNL030W 312 nt3.31□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 YAP7YOL028C 738 nt3.31□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 SME1YOR159C 285 nt3.31□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 MTR4YJL050W 3222 nt3.31□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 YDL176WYDL176W 2127 nt3.31□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 NDC80YIL144W 2076 nt3.31□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 GCD2YGR083C 1956 nt3.31□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 YOR296WYOR296W 3870 nt3.3□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 JIP5YPR169W 1479 nt3.3□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 HEF3YNL014W 3135 nt3.3□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 RTT109YLL002W 1311 nt3.3□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 FAP7YDL166C 594 nt3.3□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 YDL242WYDL242W 354 nt3.3□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 DPP1YDR284C 870 nt3.3□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 SPT4YGR063C 309 nt3.3□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 GTR2YGR163W 1026 nt3.3□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 AIM19YIL087C 474 nt3.3□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 MBB1YJL199C 327 nt3.3□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 GPX1YKL026C 504 nt3.3□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 TVP18YMR071C 504 nt3.3□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 YNL184CYNL184C 327 nt3.3□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 RPS7AYOR096W 573 nt3.3□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 AUS1YOR011W 4185 nt3.3□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 YLR352WYLR352W 2424 nt3.3□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 URK1YNR012W 1506 nt3.29□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 UBP5YER144C 2418 nt3.29□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 YDR203WYDR203W 318 nt3.29□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 YGR039WYGR039W 312 nt3.29□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 AIM18YHR198C 966 nt3.29□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 CTK2YJL006C 972 nt3.29□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.29□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 APD1YBR151W 951 nt3.29□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 AI4Q0065 1671 nt3.29□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 STU1YBL034C 4542 nt3.29□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 CDC5YMR001C 2118 nt3.29□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 REG1YDR028C 3045 nt3.29□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 CIN8YEL061C 3003 nt3.28□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 VPS38YLR360W 1320 nt3.28□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 YDR250CYDR250C 276 nt3.28□□□□□ -1.88
CTF3Q12748 THO1YER063W 657 nt3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.4 ms