Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE4CQ08493 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE4CQ08493 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms