Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CYP4F3Q08477 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms