Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NrepQ07475 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NrepQ07475 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms