Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SryQ05738 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SryQ05738 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SryQ05738 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SryQ05738 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SryQ05738 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SryQ05738 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SryQ05738 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SryQ05738 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SryQ05738 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SryQ05738 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SryQ05738 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SryQ05738 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SryQ05738 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SryQ05738 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SryQ05738 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SryQ05738 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SryQ05738 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SryQ05738 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SryQ05738 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SryQ05738 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SryQ05738 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SryQ05738 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SryQ05738 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SryQ05738 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SryQ05738 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SryQ05738 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SryQ05738 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SryQ05738 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SryQ05738 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SryQ05738 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SryQ05738 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SryQ05738 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SryQ05738 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SryQ05738 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SryQ05738 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SryQ05738 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SryQ05738 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SryQ05738 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SryQ05738 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SryQ05738 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SryQ05738 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SryQ05738 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SryQ05738 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SryQ05738 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SryQ05738 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SryQ05738 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SryQ05738 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SryQ05738 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SryQ05738 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SryQ05738 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SryQ05738 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SryQ05738 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SryQ05738 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SryQ05738 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SryQ05738 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SryQ05738 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SryQ05738 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SryQ05738 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SryQ05738 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SryQ05738 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SryQ05738 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SryQ05738 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SryQ05738 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SryQ05738 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SryQ05738 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SryQ05738 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SryQ05738 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SryQ05738 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SryQ05738 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SryQ05738 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SryQ05738 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SryQ05738 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SryQ05738 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SryQ05738 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SryQ05738 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SryQ05738 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SryQ05738 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SryQ05738 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SryQ05738 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SryQ05738 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SryQ05738 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SryQ05738 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SryQ05738 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SryQ05738 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SryQ05738 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SryQ05738 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SryQ05738 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SryQ05738 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SryQ05738 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SryQ05738 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SryQ05738 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SryQ05738 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SryQ05738 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SryQ05738 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SryQ05738 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SryQ05738 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SryQ05738 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SryQ05738 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SryQ05738 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 273.3 ms