Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms