Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPD1P62314 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPD1P62314 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPD1P62314 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPD1P62314 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPD1P62314 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPD1P62314 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNRPD1P62314 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD1P62314 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD1P62314 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD1P62314 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD1P62314 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD1P62314 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD1P62314 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD1P62314 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD1P62314 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD1P62314 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD1P62314 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD1P62314 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD1P62314 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD1P62314 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD1P62314 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD1P62314 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD1P62314 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD1P62314 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD1P62314 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD1P62314 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD1P62314 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD1P62314 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD1P62314 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNRPD1P62314 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD1P62314 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD1P62314 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD1P62314 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD1P62314 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD1P62314 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD1P62314 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD1P62314 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD1P62314 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD1P62314 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD1P62314 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD1P62314 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD1P62314 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD1P62314 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD1P62314 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD1P62314 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD1P62314 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD1P62314 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD1P62314 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD1P62314 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD1P62314 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD1P62314 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD1P62314 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD1P62314 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNRPD1P62314 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD1P62314 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD1P62314 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD1P62314 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD1P62314 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD1P62314 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD1P62314 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD1P62314 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD1P62314 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD1P62314 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD1P62314 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD1P62314 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD1P62314 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD1P62314 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD1P62314 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD1P62314 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD1P62314 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD1P62314 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD1P62314 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD1P62314 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD1P62314 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNRPD1P62314 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD1P62314 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD1P62314 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD1P62314 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD1P62314 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD1P62314 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD1P62314 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD1P62314 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD1P62314 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD1P62314 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD1P62314 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD1P62314 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD1P62314 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD1P62314 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD1P62314 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD1P62314 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD1P62314 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD1P62314 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD1P62314 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD1P62314 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD1P62314 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD1P62314 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SNRPD1P62314 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPD1P62314 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPD1P62314 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms