Protein–RNA interactions for Protein: P51164

ATP4B, Potassium-transporting ATPase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4BP51164 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP4BP51164 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms