Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SftpdP50404 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SftpdP50404 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SftpdP50404 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SftpdP50404 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SftpdP50404 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SftpdP50404 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SftpdP50404 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SftpdP50404 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SftpdP50404 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SftpdP50404 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms