Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCLMP48507 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GCLMP48507 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCLMP48507 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCLMP48507 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCLMP48507 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCLMP48507 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCLMP48507 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCLMP48507 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCLMP48507 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GCLMP48507 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLMP48507 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLMP48507 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLMP48507 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLMP48507 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLMP48507 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLMP48507 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLMP48507 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLMP48507 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLMP48507 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLMP48507 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLMP48507 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLMP48507 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLMP48507 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLMP48507 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLMP48507 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLMP48507 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLMP48507 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLMP48507 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLMP48507 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCLMP48507 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCLMP48507 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCLMP48507 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCLMP48507 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCLMP48507 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCLMP48507 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCLMP48507 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCLMP48507 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCLMP48507 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GCLMP48507 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GCLMP48507 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCLMP48507 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLMP48507 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLMP48507 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLMP48507 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLMP48507 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLMP48507 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLMP48507 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLMP48507 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLMP48507 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLMP48507 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLMP48507 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLMP48507 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLMP48507 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLMP48507 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLMP48507 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLMP48507 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLMP48507 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCLMP48507 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLMP48507 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLMP48507 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLMP48507 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLMP48507 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLMP48507 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLMP48507 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLMP48507 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLMP48507 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLMP48507 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLMP48507 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLMP48507 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLMP48507 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCLMP48507 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLMP48507 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCLMP48507 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms