Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms