Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms