Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CenpbP27790 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpbP27790 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpbP27790 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenpbP27790 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CenpbP27790 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CenpbP27790 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CenpbP27790 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CenpbP27790 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CenpbP27790 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CenpbP27790 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms