Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 1700039M10Rik-201ENSMUST00000180397 532 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 C030010L15Rik-201ENSMUST00000181465 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxd11P23813 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms