Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP20293 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP20293 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP20293 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP20293 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP20293 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP20293 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP20293 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP20293 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP20293 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP20293 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP20293 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP20293 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TP20293 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP20293 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP20293 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP20293 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP20293 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP20293 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP20293 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TP20293 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP20293 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP20293 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP20293 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP20293 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP20293 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP20293 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP20293 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP20293 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP20293 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP20293 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP20293 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TP20293 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP20293 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP20293 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP20293 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP20293 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP20293 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP20293 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TP20293 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP20293 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP20293 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP20293 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP20293 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP20293 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP20293 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP20293 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP20293 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP20293 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP20293 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP20293 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TP20293 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP20293 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP20293 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP20293 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP20293 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP20293 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP20293 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP20293 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP20293 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TP20293 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP20293 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP20293 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP20293 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP20293 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP20293 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP20293 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP20293 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP20293 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TP20293 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP20293 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP20293 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP20293 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP20293 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP20293 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP20293 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP20293 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP20293 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP20293 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP20293 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP20293 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP20293 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP20293 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP20293 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TP20293 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TP20293 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TP20293 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TP20293 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TP20293 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TP20293 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TP20293 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TP20293 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TP20293 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TP20293 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TP20293 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TP20293 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TP20293 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TP20293 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TP20293 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TP20293 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms