Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGAMP11215 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms