Protein–RNA interactions for Protein: O88533

Ddc, Aromatic-L-amino-acid decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DdcO88533 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DdcO88533 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DdcO88533 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DdcO88533 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DdcO88533 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DdcO88533 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DdcO88533 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DdcO88533 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DdcO88533 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DdcO88533 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DdcO88533 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DdcO88533 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DdcO88533 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DdcO88533 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DdcO88533 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DdcO88533 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DdcO88533 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DdcO88533 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DdcO88533 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DdcO88533 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DdcO88533 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DdcO88533 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DdcO88533 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DdcO88533 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DdcO88533 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DdcO88533 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DdcO88533 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DdcO88533 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DdcO88533 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DdcO88533 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DdcO88533 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DdcO88533 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DdcO88533 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DdcO88533 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DdcO88533 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DdcO88533 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DdcO88533 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DdcO88533 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DdcO88533 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DdcO88533 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DdcO88533 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DdcO88533 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DdcO88533 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DdcO88533 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DdcO88533 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DdcO88533 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DdcO88533 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DdcO88533 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DdcO88533 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
DdcO88533 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
DdcO88533 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DdcO88533 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DdcO88533 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DdcO88533 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DdcO88533 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DdcO88533 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DdcO88533 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DdcO88533 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DdcO88533 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DdcO88533 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DdcO88533 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DdcO88533 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DdcO88533 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DdcO88533 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DdcO88533 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DdcO88533 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DdcO88533 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DdcO88533 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DdcO88533 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DdcO88533 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DdcO88533 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DdcO88533 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DdcO88533 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DdcO88533 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DdcO88533 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DdcO88533 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DdcO88533 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DdcO88533 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DdcO88533 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DdcO88533 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DdcO88533 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DdcO88533 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DdcO88533 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DdcO88533 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DdcO88533 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DdcO88533 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DdcO88533 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DdcO88533 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DdcO88533 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DdcO88533 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DdcO88533 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DdcO88533 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DdcO88533 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DdcO88533 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DdcO88533 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DdcO88533 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DdcO88533 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DdcO88533 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DdcO88533 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DdcO88533 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms