Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXA2O43364 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms