Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Speer4cG3UXD1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Speer4cG3UXD1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Speer4cG3UXD1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Speer4cG3UXD1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms