Protein–RNA interactions for Protein: C9IYK1

Gap junction protein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9IYK1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9IYK1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9IYK1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9IYK1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9IYK1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9IYK1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9IYK1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9IYK1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9IYK1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9IYK1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C9IYK1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9IYK1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9IYK1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9IYK1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9IYK1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9IYK1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9IYK1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9IYK1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9IYK1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9IYK1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9IYK1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9IYK1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9IYK1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9IYK1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9IYK1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9IYK1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9IYK1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9IYK1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C9IYK1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9IYK1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9IYK1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C9IYK1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9IYK1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9IYK1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9IYK1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9IYK1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9IYK1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9IYK1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C9IYK1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9IYK1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9IYK1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9IYK1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C9IYK1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9IYK1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9IYK1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9IYK1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9IYK1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C9IYK1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9IYK1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9IYK1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9IYK1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9IYK1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9IYK1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9IYK1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9IYK1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9IYK1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9IYK1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9IYK1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9IYK1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9IYK1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9IYK1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9IYK1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9IYK1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9IYK1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C9IYK1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C9IYK1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9IYK1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9IYK1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9IYK1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C9IYK1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9IYK1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9IYK1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9IYK1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9IYK1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C9IYK1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9IYK1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9IYK1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9IYK1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C9IYK1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9IYK1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9IYK1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9IYK1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9IYK1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9IYK1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9IYK1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9IYK1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9IYK1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9IYK1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9IYK1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9IYK1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9IYK1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C9IYK1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9IYK1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C9IYK1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9IYK1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9IYK1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9IYK1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9IYK1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9IYK1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9IYK1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms