Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem238A9JSM3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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