Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
XIRP2A4UGR9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XIRP2A4UGR9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms