Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMD3A2A2Y4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMD3A2A2Y4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms