Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIX9

Cfap99, Cilia and flagella-associated protein 99, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap99A0A140LIX9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfap99A0A140LIX9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap99A0A140LIX9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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