Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ino80eA0A0U1RP99 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ino80eA0A0U1RP99 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms