Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI1Q9Y6G9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms