Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MRPL11Q9Y3B7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms