Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC4Q9Y296 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms