Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pcsk1nQ9QXV0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pcsk1nQ9QXV0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms