Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPCPD1Q9NPB8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms